Es una parroquia histórica desaparecida. En la actualidad, no existe como templo físico independiente ni como parroquia activa, ya que fue absorbida hace siglos dentro de los procesos de reorganización eclesiástica de la ciudad.
Durante la repoblación medieval y hasta principios del siglo XVI, la villa de Béjar experimentó un gran auge demográfico. Llegó a contar con un total de diez parroquias históricas. El punto de inflexión para este templo ocurrió en 1568, año en el que se ejecutó la llamada "reducción parroquial" de Béjar por el Obispo de Plasencia Pedro Ponce de León. Debido a la dispersión de feligreses y criterios de eficiencia eclesiástica, las diez parroquias existentes se suprimieron administrativamente y el mapa religioso de la ciudad se redujo a solo tres grandes parroquias matrices: Santa María la Mayor, El Salvador y San Juan Bautista. Como consecuencia de este arreglo parroquial, la Parroquia de San Pedro perdió su autonomía, y su feligresía y bienes fueron aglutinados y absorbidos por la Parroquia de Santa María la Mayor (junto con la de Santiago y San Andrés). Tras quedarse sin culto oficial y sin mantenimiento, el edificio terminó desapareciendo con el paso de los siglos.